The value of position-specific scoring matrices for assessment of protein allegenicity
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
assessment of the park- ang damage index for performance levels of rc moment resisting frames
چکیده هدف اصلی از طراحی لرزه ای تامین ایمنی جانی در هنگام وقوع زلزله و تعمیر پذیر بودن سازه خسارت دیده، پس از وقوع زلزله است. تجربه زلزله های اخیر نشان داده است که ساختمان های طراحی شده با آیین نامه های مبتنی بر نیرو از نظر محدود نمودن خسارت وارده بر سازه دقت لازم را ندارند. این امر سبب پیدایش نسل جدید آیین نامه های مبتنی بر عملکرد شده است. در این آیین نامه ها بر اساس تغییرشکل های غیرارتجاعی ...
15 صفحه اولNature of Protein Family Signatures: Insights from Singular Value Analysis of Position-Specific Scoring Matrices
Position-specific scoring matrices (PSSMs) are useful for detecting weak homology in protein sequence analysis, and they are thought to contain some essential signatures of the protein families. In order to elucidate what kind of ingredients constitute such family-specific signatures, we apply singular value decomposition to a set of PSSMs and examine the properties of dominant right and left s...
متن کاملassessment of the efficiency of s.p.g.c refineries using network dea
data envelopment analysis (dea) is a powerful tool for measuring relative efficiency of organizational units referred to as decision making units (dmus). in most cases dmus have network structures with internal linking activities. traditional dea models, however, consider dmus as black boxes with no regard to their linking activities and therefore do not provide decision makers with the reasons...
Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices.
A two-stage neural network has been used to predict protein secondary structure based on the position specific scoring matrices generated by PSI-BLAST. Despite the simplicity and convenience of the approach used, the results are found to be superior to those produced by other methods, including the popular PHD method according to our own benchmarking results and the results from the recent Crit...
متن کاملconditional copula-garch methods for value at risk of portfolio: the case of tehran stock exchange market
ارزش در معرض ریسک یکی از مهمترین معیارهای اندازه گیری ریسک در بنگاه های اقتصادی می باشد. برآورد دقیق ارزش در معرض ریسک موضوع بسیارمهمی می باشد و انحراف از آن می تواند موجب ورشکستگی و یا عدم تخصیص بهینه منابع یک بنگاه گردد. هدف اصلی این مطالعه بررسی کارایی روش copula-garch شرطی در برآورد ارزش در معرض ریسک پرتفویی متشکل از دو سهام می باشد و ارزش در معرض ریسک بدست آمده با روشهای سنتی برآورد ارزش د...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BMC Bioinformatics
سال: 2008
ISSN: 1471-2105
DOI: 10.1186/1471-2105-9-s12-s21